经历过热闹的春节,多篇依托 abinScience 技术支持的抗体与蛋白质研究突破性成果,也相继发表于《Genome Biology》《Nature Communications》等期刊。研究聚焦植物抗真菌肽(AFPs)识别人工智能工具、转录暂停因子 NELF、自身免疫性葡萄膜炎(AU)等关键方向,覆盖疾病机制解析、靶点筛选等核心领域。abinScience提供的高纯度重组蛋白与抗体,为相关科研工作提供了关键物质支撑,助力多项研究实现核心突破。本期文献速递,让我们一同回顾这些来自一线实验室的重要研究进展。
No.I
标题:FungiGuard: identification of plant antifungal peptides with artificial intelligence
期刊:Genome Biology
影响因子:9.4
作者单位:上海交通大学
植物抗真菌肽(AFPs)是植物抗生物胁迫的关键,但目前尚无专门识别植物 AFPs 的人工智能工具,且传统实验筛选方法效率低、植物 AFPs 数据集有限。本研究据此开发了集成随机森林、长短时记忆网络及注意力机制的集成模型 FungiGuard,以带功能注释的植物小肽为训练集,其在植物 AFPs 分类上的精度远超通用模型 AFP-MFL。研究通过 FungiGuard 筛选拟南芥、小麦等四种作物的小开放阅读框及拟南芥非经典阅读框,识别出多个候选 AFPs,实验验证 AtcAFP5 对灰葡萄孢菌具有剂量依赖性抑制作用,且 T19、T20 残基是其发挥活性的关键。此外,该模型还从随机生成序列中发现了新型 AFPs,并证实预测 AFPs 与已验证 AFPs 在结构、理化性质上高度相似。FungiGuard 为植物 AFPs 挖掘提供了高效工具,也为农业抗真菌研究提供了新方向,仅存在训练数据集规模有限、验证菌株单一等局限性。
abinScience在本研究中仅提供了抗 GFP 抗体(货号:ZP144063),用于蛋白提取后的蛋白质免疫印迹(Western blotting)实验。研究通过农杆菌介导的瞬时表达体系表达候选AFPs与GFP融合蛋白,利用 abinScience 的抗 GFP 抗体检测融合蛋白的表达条带,以此确认 AtcAFP3、AtcAFP5 等候选肽的成功表达,为后续抗真菌活性验证实验奠定了关键的蛋白表达基础。
No.2
标题:HSPA1A and DNAJB1 regulate NELF condensate dynamics to safeguard transcriptional recovery under heat stress
期刊:Molecular Cell
影响因子:16.6
作者单位:浙江大学
热应激下,转录暂停因子 NELF 会形成核凝聚体,但其动态调控及与转录适应的关联尚不明确。该研究开发了纳米抗体邻近标记技术(NbPro),鉴定出分子伴侣 HSPA1A 和 DNAJB1 是 NELF 凝聚体动态的关键调控因子。研究发现,DNAJB1 通过其 CTD 结构域识别 NELFA 的触手结构域,招募 HSPA1A 维持 NELF 凝聚体的液态可逆性;缺失二者会导致凝聚体呈凝胶 / 固态、NELFA 磷酸化持续、染色质结合受损,进而破坏 RNA Pol II 启动子近端暂停,释放无功能的不成熟 RNA Pol II,阻碍转录恢复。结论表明,HSPA1A-DNAJB1 介导的凝聚体动态调控是热应激后转录恢复的关键,揭示启动子近端暂停是防止不成熟 RNA Pol II 逃逸的质控 checkpoint,而非单纯的转录抑制机制。
abinScience 为本研究提供了Benzonase 核酸酶(货号:JN844012)。该试剂用于染色质组分免疫沉淀(Chromatin fraction IP)实验中,在 4℃下消化染色质,助力后续染色质结合蛋白的免疫沉淀与分析。通过降解染色质中的核酸,释放结合于染色质上的蛋白质复合物,确保 NELF 与 RNA Pol II 的相互作用、NELF 染色质占据率等关键实验数据的准确性。
No.3
标题:Artesunate ameliorates experimental autoimmune uveitis by inhibiting the LCN2-STAT3 axis and suppressing microglial activation
期刊:Redox Report
影响因子:7.4
作者单位:武汉大学人民医院眼科中心
自身免疫性葡萄膜炎(AU)是致盲性眼内炎症疾病,常规治疗存在耐药性、复发等问题,急需新型药物。该研究探究青蒿琥酯(ART)对实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)的治疗效果及机制。结果显示,ART 经口服灌胃可显著改善 EAU 小鼠的临床和组织病理学评分,通过表面等离子体共振(SPR)分析证实其与 LCN2、STAT3 存在中等亲和力结合。ART能抑制小胶质细胞活化,下调 LCN2 和 STAT3 的表达,减少 IL-6、IL-1β 等促炎因子释放,同时降低 ROS 水平、恢复 SOD 活性,抑制 Th17 细胞分化。结论表明,ART 通过靶向 LCN2-STAT3 信号轴,发挥抗炎和抗氧化作用,有效缓解 EAU,有望成为治疗自身免疫性葡萄膜炎的潜在药物。
abinScience 在研究中提供了STAT3 蛋白(货号:MW708011)。该蛋白用于 SPR实验,被固定在CM5传感器芯片的流动池 4 上,与 LCN2 蛋白共同用于检测 ART 与其的直接结合作用,最终明确了 ART 与 STAT3 的亲和力常数(KD=71.9 μM)。为 ART 的分子靶点验证提供关键实验材料,直接支撑了 “ART 通过与 STAT3 结合抑制其活化” 这一核心机制的论证。
No.4
标题:Tumor-derived S100A14 targeted astrocytes via TLR4 to Recruit myeloid-derived suppressor cells promoting brain metastasis and Curdione reversal effect
期刊:Phytomedicine
影响因子:8.3
作者单位:广东省中医药转化型癌症研究重点实验室
脑转移(BrM)是肿瘤患者常见且致死率高的并发症,S100A14 在其中的作用机制及靶向药物尚不明晰。本研究发现,S100A14 在肺癌脑转移患者血清中高表达,且与乳腺癌、肺癌患者总生存期呈负相关。机制上,肿瘤分泌的 S100A14 通过结合星形胶质细胞表面的 TLR4,激活 NF-κB 信号通路,诱导星形胶质细胞分泌 IL-6、CCL2 和 CXCL1 等细胞因子与趋化因子,招募多形核和单核髓系来源抑制细胞(MDSCs),构建脑部免疫抑制微环境,促进肿瘤脑转移。此外,姜黄二酮(Curdione)被鉴定为 S100A14 的有效抑制剂,可逆转上述级联反应,显著抑制乳腺癌和肺癌的脑转移。该研究证实 S100A14 是脑转移的临床相关生物标志物和治疗靶点,为脑转移治疗提供了新策略。
abinScience为研究提供了纯化的重组 S100A14 蛋白(货号:MV491012)。直接用于体外功能验证实验:一是通过 Transwell 和划痕愈合实验,证实 S100A14 能浓度依赖性增强星形胶质细胞的迁移能力;二是用于验证S100A14与星形胶质细胞 TLR4 的相互作用及下游 NF-κB 信号通路激活,为 “肿瘤 - S100A14 - 星形胶质细胞 - MDSCs” 调控轴的阐明提供了关键工具。支撑了 S100A14 促进脑转移的核心机制论证,同时为姜黄二酮的靶向抑制效果验证提供了标准化靶点,是整个研究结论成立的重要物质基础。
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